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基于同步辐射X射线荧光光谱与机器学习的非靶标金属组学方法区分暴露于不同形态汞的水稻
敖飘雪; 魏超杰; 解宏鑫; 费钰茜; 崔丽巍; 王伟; 涂成龙; 商立海; 李柏; 李玉锋
2024
Source Publication环境与职业医学
Volume41Issue:10Pages:1095-1102
Abstract

汞是一种全球性污染物,严重威胁人类健康。不同形态汞的毒性不同,建立区分暴露于不同形态汞的样品的方法有助于针对性开展汞的治理,为降低人类汞暴露风险提供依据。[目的]建立基于同步辐射X射线荧光(SRXRF)光谱与机器学习相结合的非靶标金属组学方法,从而区分暴露于无机汞(IHg)或甲基汞(MeHg)的水稻。[方法]水稻种子分别暴露于超纯水(对照组)、0.1 mg·L-1的IHg(IHg组)或MeHg(MeHg组)溶液中,种子发芽后继续培养21 d,收集水稻叶片、烘干、称重、压片。利用SRXRF测定各组水稻叶中金属组的含量。采用不同机器学习模型如软独立建模聚类分析(SIMCA)、最小二乘判别分析(PLS-DA)和逻辑回归(LR)对不同组叶片的SRXRF全光谱进行分类和识别,筛选出区分效果最优的模型以区分暴露于IHg或MeHg的水稻。进一步利用特征元素作为输入参数以提升运算速度,减少模型计算量,优化模型。[结果] SRXRF显示,对照组、IHg组和MeHg组的SRXRF光谱强度各不相同,提示IHg或MeHg暴露可干扰水稻叶中金属组的稳态平衡。将SRXRF光谱进行主成分分析(PCA),发现对照组能与汞暴露组很好区分,但无法区分IHg组和MeHg组。利用PLS-DA、SIMCA和LR三个模型进行区分,发现训练集的准确率都高于98%,验证集的准确率都高于95%,交叉验证集的准确率都高于94%,其中LR模型的准确率均高于PLS-DA模型和SIMCA模型。以线性模型LR挑选出的K、Ca、Mn、Fe、Zn为特征元素区分IHg组和MeHg组的预测准确率为92.05%。与全光谱模型相比,利用特征光谱预测模型虽然预测准确率下降,但模型输入参数减少了99.51%,且精确度、召回率和F1得分在84.48%以上,同样可用于区分暴露于不同形态汞的水稻。[结论]基于SRXRF和机器学习的非靶标金属组学方法可快速识别暴露于不同形态汞的水稻,减少人体摄入汞的风险。

Keyword无机汞 甲基汞 水稻 同步辐射x射线荧光光谱 机器学习 非靶标金属组学
Indexed ByCSCD
Language中文
CSCD IDCSCD:7842596
Citation statistics
Cited Times:1[CSCD]   [CSCD Record]
Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.gyig.ac.cn/handle/42920512-1/15436
Collection环境地球化学国家重点实验室
Affiliation1.贵州医科大学公共卫生与健康学院/环境污染与疾病监控教育部重点实验室 2.
2.中国农业大学工学院/全国金属组学创新研究中心
3.中国科学院高能物理研究所/中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室/中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室/北京金属组学平台/全国金属组学创新研究中心
4.河南农业大学国际教育学院
5.中国科学院大学资源与环境学院
6.中国科学院地球化学研究所/环境地球化学国家重点实验室
Recommended Citation
GB/T 7714
敖飘雪,魏超杰,解宏鑫,等. 基于同步辐射X射线荧光光谱与机器学习的非靶标金属组学方法区分暴露于不同形态汞的水稻[J]. 环境与职业医学,2024,41(10):1095-1102.
APA 敖飘雪.,魏超杰.,解宏鑫.,费钰茜.,崔丽巍.,...&李玉锋.(2024).基于同步辐射X射线荧光光谱与机器学习的非靶标金属组学方法区分暴露于不同形态汞的水稻.环境与职业医学,41(10),1095-1102.
MLA 敖飘雪,et al."基于同步辐射X射线荧光光谱与机器学习的非靶标金属组学方法区分暴露于不同形态汞的水稻".环境与职业医学 41.10(2024):1095-1102.
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